Еще одно крупное преимущество сборок — встроенное управление версиями, знаменующее собой конец "ада DLL". Речь идет о ситуации, когда одно приложение затирает DLL, нужную другому, обычно записывая поверх нее более раннюю версию этой же DLL, выводя из строя первое приложение. Хотя формат файлов ресурсов Win32 допускает наличие ресурса, определяющего версию, ОС не контролирует версии. Ответственность за это целиком и полностью несут прикладные программисты. Для решения этой проблемы в декларацию включена информация о версии сборки, а также список сборок, на которые ссылается данная сборка, с указанием их версий. Такая архитектура позволяет исполняющей среде .NET гарантировать поддержку политик управления версиями и продолжение функционирования приложения даже после установки в систему более новых, несовместимых версий совместно используемых DLL. Управление версиями описано в соответствующем разделе.